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Webpay vs Mercado Pago: diferencias para tu tienda online

5 de julio de 2026 · ESBUENISIMO LABS

Al comparar Webpay vs Mercado Pago, la primera diferencia que nota cualquier emprendedor es la facilidad de acceso: Mercado Pago permite empezar a cobrar en minutos, mientras que Webpay exige un proceso de afiliación más formal a través de Transbank. Pero la decisión no debería basarse solo en la rapidez de activación, sino en comisiones, tiempos de liquidación del dinero y qué medio de pago prefieren realmente los compradores chilenos.

Qué es Webpay y qué es Mercado Pago

Webpay Plus es la pasarela de pago de Transbank, la empresa que procesa la gran mayoría de las transacciones con tarjeta en Chile. Permite cobrar con tarjetas de crédito, débito Redcompra y prepago de los principales bancos del país, liquidando el dinero directamente en la cuenta corriente del comercio afiliado. Mercado Pago, en cambio, es la plataforma de pagos de Mercado Libre, pensada para que cualquier persona o pyme pueda cobrar online sin necesidad de tener una cuenta bancaria comercial ni pasar por un proceso de afiliación tradicional con un banco.

Cómo funciona Webpay en una tienda online

Para integrar Webpay, el comercio debe afiliarse directamente con Transbank o a través de un integrador certificado (como plataformas de ecommerce que ya traen el módulo instalado). El proceso de afiliación pide antecedentes formales del negocio: iniciación de actividades, cuenta bancaria a nombre de la empresa y, en algunos casos, evaluación comercial. Una vez afiliado, el checkout redirige al cliente a la pantalla de Webpay, donde ingresa los datos de su tarjeta, y el dinero se liquida en la cuenta del comercio según el ciclo de pago acordado, típicamente entre 1 y 3 días hábiles.

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Elegir entre Webpay y Mercado Pago depende del tamaño de la tienda, la rapidez de activación necesaria y la estructura de comisiones.

Cómo funciona Mercado Pago en una tienda online

Mercado Pago permite crear una cuenta y empezar a cobrar el mismo día, sin necesidad de una evaluación comercial extensa. El dinero de las ventas queda disponible en el saldo de la cuenta de Mercado Pago, desde donde se puede transferir a una cuenta bancaria propia, ya sea de forma gratuita en un plazo de días o de forma instantánea pagando una comisión adicional. Esto lo hace especialmente atractivo para tiendas nuevas, emprendimientos que recién están formalizándose o vendedores que operan también dentro del marketplace de Mercado Libre.

AspectoWebpayMercado Pago
Proceso de afiliaciónMás formal, requiere evaluación comercialInmediato, con solo crear una cuenta
Liquidación del dineroDirecto a cuenta bancaria, 1-3 días hábilesA saldo Mercado Pago; transferencia gratis (días) o instantánea (con costo)
Medios de pago aceptadosTarjetas de crédito, débito Redcompra, prepagoTarjetas, saldo Mercado Pago, transferencia, QR
Reconocimiento de marcaAlto entre bancos y comercio establecidoAlto entre usuarios de Mercado Libre
Ideal paraTiendas formalizadas con volumen medio-altoEmprendimientos nuevos o de bajo volumen inicial

Comisiones: cuánto cobra cada pasarela de pago

Ambas plataformas cobran una comisión por transacción que se descuenta automáticamente del monto vendido, y ambas actualizan sus tarifas con cierta frecuencia según el rubro, el volumen mensual del comercio y el tipo de tarjeta usada por el cliente. Como norma general, conviene simular el costo real revisando la calculadora de comisiones vigente en el sitio de cada proveedor antes de decidir, en vez de guiarse por cifras que circulan desactualizadas. Lo que sí se mantiene estable es la lógica: a mayor volumen de ventas mensual, ambas pasarelas suelen ofrecer tasas preferenciales negociadas caso a caso.

  • Webpay: la comisión se negocia según el volumen y el plan contratado con Transbank o el integrador, y suele ser más competitiva para comercios con ventas mensuales altas y estables.
  • Mercado Pago: cobra una comisión por cada venta procesada con tarjeta, generalmente algo más alta que Webpay para volúmenes bajos, pero sin costos fijos mensuales ni mínimos de facturación.

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Las comisiones de cada pasarela cambian según el volumen de ventas, por lo que conviene simular el costo real antes de elegir.

Si tu tienda recién está partiendo, también puede convenirte revisar el modelo de dropshipping antes de decidir qué pasarela de pago se ajusta mejor a tu operación.

Qué medio de pago prefieren los compradores chilenos

La tarjeta de débito Redcompra sigue siendo el medio de pago más usado por los chilenos en compras online, seguida de las tarjetas de crédito bancarias. Mercado Pago ha ganado terreno especialmente entre compradores que ya tienen saldo o tarjeta guardada en la plataforma por comprar habitualmente en el marketplace de Mercado Libre. Para una tienda propia (fuera del marketplace), lo más común es ofrecer ambas opciones cuando el volumen de ventas lo justifica, ya que cada una capta un segmento distinto de compradores.

Cuál conviene para tu tienda online

Si la tienda ya está formalizada, tiene un flujo de ventas mensual estable y busca minimizar comisiones a largo plazo, Webpay suele ser la opción más eficiente. Si el negocio recién está empezando, necesita activarse rápido o vende también dentro del marketplace de Mercado Libre, Mercado Pago reduce la fricción inicial. Muchas tiendas medianas terminan ofreciendo ambas opciones en el checkout, dejando que el comprador elija el medio de pago con el que se siente más cómodo, lo que en la práctica sube la tasa de conversión general del sitio.

Una tienda que quiere ganar visibilidad frente a competidores mejor posicionados en Google necesita, además de un buen checkout, el respaldo de una agencia de prensa que construya autoridad y confianza de marca en el mediano plazo.

Preguntas frecuentes

¿Puedo tener Webpay y Mercado Pago activos al mismo tiempo en mi tienda?

Sí, la mayoría de las plataformas de ecommerce (Shopify, Tienda Nube, WooCommerce) permiten integrar ambas pasarelas simultáneamente, mostrando al cliente las opciones disponibles en el checkout. Esto aumenta la conversión al no restringir el medio de pago del comprador.

¿Cuál tiene menos comisión, Webpay o Mercado Pago?

Depende del volumen de ventas y del plan contratado. En general, Webpay tiende a ser más competitivo para comercios con ventas altas y estables, mientras que Mercado Pago no exige mínimos ni costos fijos, lo que puede convenir a tiendas nuevas o de bajo volumen. Lo recomendable es simular ambos escenarios con el volumen real de la tienda antes de decidir.

¿Necesito tener empresa formalizada para usar Mercado Pago?

No necesariamente para empezar, ya que Mercado Pago permite operar como persona natural en etapas iniciales. Sin embargo, para escalar el negocio, emitir boletas o facturas y operar con Webpay, sí se requiere iniciar actividades ante el SII.

¿Qué pasa si un cliente reclama un pago o pide devolución?

Ambas plataformas tienen procesos de reversa y disputa de pagos. Webpay gestiona las devoluciones a través del comercio y el banco emisor de la tarjeta, mientras que Mercado Pago tiene su propio sistema de mediación integrado en la plataforma, generalmente más rápido de resolver para el vendedor.

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